H δυνατή βροχή στην πίστα της Sepang είχε ως αποτέλεσμα μία 20λεπτη καθυστέρηση στην εκκίνηση του αγώνα και τη μείωση της απόστασης του αγώνα κατά ένα γύρο. Όλοι οι οδηγοί ξεκίνησαν με βρόχινα ελαστικά. Οι περισσότεροι επέλεξαν τη μέση γόμα, με εξαιρέσεις τον Aleix Espargaro και τον Hiroshi Aoyama, με μαλακό πίσω ελαστικό, αλλά και τον Yonny Hernandez, με μαλακό μπροστά.

Στην εκκίνηση, ο Jorge Lorenzo πήρε την πρώτη θέση, με τους Marquez, Dovizioso, Rossi, Iannone και Aleix Espargaro. Κατά τη διάρκεια του γύρου είδαμε πολλές αλλαγές στην κατάταξη και στο τέλος του πρώτου γύρου ήταν ως εξής: Rossi, Iannone, Dovizioso, Marquez, Aleix Espargaro και Lorenzo.

Προς το τέλος του δεύτερου γύρου, ο Iannone πήρε την πρωτοπορία, ενώ λίγες στροφές αργότερα ο Aleix Espargaro έχασε τα φρένα και βρέθηκε εκτός πίστας. Δεν έπεσε και συνέχισε τον αγώνα, από τη 13η θέση. Στον πέμπτο γύρο, ο Cal Crutchlow πέρασε τον Lorenzo και τον Marquez, ενώ ο Rossi ξεκίνησε προσπάθεια να περάσει στον Iannone. Τελικά ο αναβάτης της Yamaha πέρασε στην τέταρτή του απόπειρα για προσπέρασμα. Ένα γύρο μετά, αυτός της Ducati ανέκτησε το προβάδισμα.

Μετά από μερικούς γύρους, στους οποίους η κατάταξη στις πρώτες θέσεις έμεινε στάσιμη, ο Marquez πέρασε τον Crutchlow, ενώ ο Lorenzo έχασε την επαφή με το γκρουπ των πρωτοπόρων. Επικεφαλής σε αυτό το γκρουπ ήταν πλέον ο Rossi, που στον 11ο γύρο πέρασε τον Iannone. Στην αρχή του επόμενο γύρου, ο Βρετανός αναβάτης έπεσε, ενώ και ο Marquez έκανε το ίδιο δύο χιλιόμετρα αργότερα! Στο μεταξύ, ο Dovizioso πέρασε τον Iannone και κυνήγησε τον Rossi, με τους τρεις Ιταλούς να είναι οι μόνοι διεκδικητές της νίκης. Ένα γύρο αργότερα, έμειναν μόνο δύο Ιταλοί, καθώς έπεσε και ο Iannone!

Με πέντε γύρους για το τέλος, ο Rossi έχασε τα φρένα στην πρώτη στροφή και ο Dovi το εκμεταλλεύτηκε για να ανεβεί στην πρώτη θέση. Άνοιξε αμέσως τη διαφορά και εξασφάλισε τη δεύτερη νίκη του στο MotoGP, μετά το Donington το 2009! Ο Rossi πήρε τη δεύτερη θέση, με τον Lorenzo να ανεβαίνει στο βάθρο. Ο Ισπανός εκμεταλλεύτηκε την υψηλή θερμοκρασία στο έδαφος για να θερμάνει τα ελαστικά του και πήρε μακράν το καλύτερό του αποτέλεσμα σε βρεγμένο οδόστρωμα φέτος. Ο Hector Barbera και ο Loris Baz έδωσαν στην Avintia ένα φανταστικό αποτέλεσμα, με την τέταρτη κι πέμπτη θέση αντίστοιχα! Ο Vinales τερμάτισε έκτος, με τους Bautista, Miller, Pol Espargaro και Petrucci να κλείνουν τη δεκάδα. Στη δωδέκατη θέση τερμάτισε ο Marc Marquez, που συνέχισε τον αγώνα μετά την πτώση του.

Pos.RiderTeamTime/Gap
1Andrea DOVIZIOSODucati Team42'27.333
2Valentino ROSSIMovistar Yamaha MotoGP3.115
3Jorge LORENZOMovistar Yamaha MotoGP11.924
4Hector BARBERAAvintia Racing19.916
5Loris BAZAvintia Racing21.353
6Maverick VIÑALESTeam SUZUKI ECSTAR22.932
7Alvaro BAUTISTAAprilia Racing Team Gresini25.829
8Jack MILLEREstrella Galicia 0,0 Marc VDS32.746
9Pol ESPARGAROMonster Yamaha Tech 333.704
10Danilo PETRUCCIOCTO Pramac Yakhnich34.280
11Marc MARQUEZRepsol Honda Team36.480
12Eugene LAVERTYPull & Bear Aspar Team36.638
13Aleix ESPARGAROTeam SUZUKI ECSTAR36.897
14Bradley SMITHMonster Yamaha Tech 345.609
15Scott REDDINGOCTO Pramac Yakhnich49.779
16Hiroshi AOYAMARepsol Honda Team52.665
17Stefan BRADLAprilia Racing Team Gresini52.784
18Tito RABATEstrella Galicia 0,0 Marc VDS54.891
Not Classified
Andrea IANNONEDucati Team7 Laps
Cal CRUTCHLOWLCR Honda8 Laps
Yonny HERNANDEZPull & Bear Aspar Team8 Laps